除了直接整顿生员士子们，教官、学官们也是极为重要的，他们是朝廷教育的主管官员，是直接和生员士子们接触的人，学风、士风首先就系于教官、学官的。
学部左侍郎吕坤就上疏称：“学校祖宗时所慎重，今天的教官徒取充位，不获实用，或聚之书院倡为讲学，有类该禅名为主静无异入定，圣如孔子犹曰博学于文，贤如颜回，子犹曰博我以文。今天的教官则以六经为糟粕，谓不立文字直可超悟，圣贤千言万语皆从心上说来，中和位育之功，皆自心上做出。今谓心亦不用曰不思善、不思恶，但看本来面目，说六经注我，非我注六经，其实是以佛老之似乱孔孟之真。”
士人的崇尚空谈，首先就是从这些德不配位的教官、学官们开始的，蔡国熙和吕坤认为造成这种现象的主要原因是教官的地位卑陋，缺员现象日益严重，而朝廷为了使得教官足数，就让一些德不配位的人充任教官，使得大明的士风由此败坏。除此之外，学官缺乏和素质低下也是一个很重要的问题，
为此，学部上疏称：“国家养士之本在学校，贞教端范在学臣。自我朝开国，教化日重，非贤才不轻授。且两京用御史，外省用按察司风宪官为之。师严而后道尊，道尊则民知敬学。近年以来，官员多不法，因而士习日敝，民伪日滋，以驰骛奔趋为良图，以剽窃漁猎为捷径，虽居常则德业无称，从仕则功能鲜效，祖宗专官造士之意，骎以沦失。”
现在对于大明的教育体系来说，教官和学官已经是到了必须要整顿的地步了，教官主要是选拔真才实学的人充当，同时要给予教官权力，能够有效的惩治这些生员，维护朝廷的法度，而对于学官，则是选拔德行高超，精明强干的官员充当。
学部在大明被认为是一个清水衙门，虽然有管理生员、教育的大权，但是受到地方各级官府等的掣肘，而地方的提学使司权力也极为有限，在这种情况下，不管是各地的提学使司还是各级学官等，都充斥着昏官、庸官，他们任德而不任怨，任逸而不任劳，若考察优劣犹关风励，一委教官，有预钻德行、规避下等，此通弊也！
所以，必须首先要整顿教官、学官，朱载坖下旨命令吏部和学部商量整顿教官和学官的相
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