在南京的秘密据点之一。与外面世界的恐慌喧嚣截然不同，宅邸深处一间布满书架、弥漫着陈旧书香和淡淡防虫药草气息的密室里，气氛是死一般的凝滞。
沈三先生（利玛窦时代曾出现的那位），如今已是一位年逾古稀、须发皆白的老者。他坐在一张硬木圈椅中，背脊挺得笔直，但握着茶杯的手，却微微颤抖。他面前的桌上，摊开放着几份字迹潦草、显然是通过特殊渠道传递的密信。
一封来自北京的残存眼线，描述了城破时的惨状，并提及“有泰西传教士汤若望等，试图保护钦天监典籍仪器，然乱兵如匪，恐难保全”。
一封来自淮扬的族人，报告“江北四镇”（高杰、刘泽清、刘良佐、黄得功）兵马异动，抢掠民财，互相攻讦，毫无北上御敌之志，并隐晦提及“有海上来人，暗中与四镇将领有所接触”。
最后一封，没有署名，只有一行用密码写就的、冰冷如铁的话：“北京火起，棋局已残。按‘归墟’第三策，启动。保存火种，等待风暴。”
“归墟第三策……”沈三先生低声重复，苍老的脸上，每一道皱纹都仿佛刻满了百年的沧桑与此刻的剧痛。那是家族世代相传的、在最坏情况下的应急预案——当中枢彻底崩溃，天下大乱，不可挽救时，家族需化整为零，将核心人员、典籍秘藏、技术图谱，通过早已准备好的多条隐秘通道，转移至海外（南洋、日本、甚至更远），或江南隐秘之处，转入彻底的、长期的潜伏，等待“风暴过后”的“重建”时机。
他抬起头，目光穿过密室小小的气窗，望向北方。那里，是北京的方向，是紫禁城的方向，是大明二百七十六年国祚终结的地方。也是百年前，他的先祖林远之，与建文皇帝、方孝孺、郭守敬的传人们，仓皇登船，开始那场漫长而绝望的文明流亡的起点。
“百年前，我们被迫出走，将文明的火种带向西方，沈三先生的声音，在寂静的密室里，低哑得如同叹息，“百年后，火种在西方燃起了不同的火，而我们留在故土的根脉，却要再次面临被连根拔起的命运。这是轮回吗？还是……我们当初选择留下，本身就是一种错误？”
密室角落里，一个三十余岁、面容沉静、眼神锐利的年轻人——沈三先生
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