成了和朝鲜、琉球一样的外藩朝贡国。
清代也和明代一样，几乎是从头重新建起了一套对乌斯藏的深入统治，但它同样没有逃过元明的命运，至清末年间，乌斯藏几乎独立，到最后真正对乌斯藏实行深入的直接统治，还得等到新中国入藏之后。
很多人将封建王朝当成了现代政府，总以为其政策是一以贯之的，但实际上，王朝政策缺乏连续性，前后统治完全割裂的情况并不少见，典型比如清初打雅克萨之战、签尼布楚条约之时，对外东北是有清楚认识的，现存大量当时材料，而到晚清，官员已经完全不知道清初这些事，对外东北的认识完全崩塌了。
知识在贵族社会是通过人与人之间的直接交往而传播的，进入平民社会以后，则是通过印刷的书本、报刊来传播，明清的士人都是出身中下层，通过读书读报来了解国家，这就导致那些没有进入公共知识领域的信息传递不到他们身上，很快就随着时间而湮灭了。
元明清三代对边疆的治理依赖于皇帝个人的能力和当地贵族的直接联系，许多政策的实施根本不会进入公共领域，到最后自然是人亡政息，再怎么牢固和深入的统治，最后也崩塌了。