都司调动官军予以弹压，才将这次聚众斗殴镇压下去，漕帮成员杀害官军三人，自相残杀十五人，朱载坖很清楚，这是在向朝廷示威，这些漕帮和运军人数众多，而且在百余年的行漕过程中，已经形成了各种大小团体，如同跗骨之蛆一样在运河上疯狂吸血，如果大明要对漕运予以改革的话，他们是肯定会跳出来阻挠大明的改革，甚至于不惜以民变、军变来威胁朝廷，好保住他们的富贵。
对于这点，朱载坖是很清楚，并且朱载坖也并不怕这些，朱载坖直接说道：“彼辈凶徒，惟有严拿惩办,庶可敛戢凶顽！”
对于这些人，朱载坖一向的态度就是很明确的，敢闹事，就要严厉打击，严惩不贷，对于运军和漕帮，要分开处理，运军毕竟也是朝廷的军户，不轨地方官府管理，按照朝廷规定，应该是由卫尉寺才处理此事，朱载坖担心的是漕帮，这些漕帮沿运河分布于南北，要想处理还真是比较麻烦的事情。
这事，需要一个酷吏来办，必须要下狠手、出重拳才行，朱载坖直接问道：“彼辈如此猖狂，当遣重臣出镇漕运，以弹压彼辈！诸卿可有人选推荐？”
张居正推荐右副都御史巡抚山东劳堪，这位确实是个酷吏，心狠手辣，作风强硬，而且在山东已经担任了两任巡抚，熟悉漕运，能够有效的处理漕帮的问题。
朱载坖当即命令升劳堪为右都御史、兵部左侍郎兼刑部左侍郎，总督漕运，与卫尉寺卿张学颜一道，巡察漕运，严惩不法，同时下诏要求漕帮限期解散，违者以逆党论处，同时从亲军诸卫和锦衣亲军中调给劳堪、张学颜士卒，充作中军，自通州巡视，对于所查缉到的凶徒还有所谓漕帮的好老等，不必经过三审六问，由劳堪审断之后，直接从刑部、大理寺复核，然后斩立决。
对于这些试图挟制朝廷的，朱载坖绝对不会客气，对他们肯定是要采取严厉的打击措施，同时对于运军也要采取相应的措施，朱载坖和内阁还有兵部尚书汪道昆、总理海军衙门俞大猷等人商量之后，决定对于运军予以调整，将这些运军调入各水师中服役。
他们毕竟精通水性，训练起来也比一般的军余子弟要容易一些，同时也可以改善现在大明水师中南方人过多的这
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