所支用的部分粮秣予以借支，先提供给李成梁部使用。
朱载坖同意了吴兑的请求，命令兵站都司继续向轮台等地转运粮秣，同时在陕甘雇佣百姓，帮助朝廷运输粮秣，大军准备进剿，对于叶尔羌汗国的用兵，是朱载坖谋划很久的事情，现在终于得以实施了，这是朱载坖现在最关键的事情，同时重臣们也很清楚，能够将西域纳入大明的版图，然后加以治理，对于现在的大明来说已经是极限了，所以重臣们也对此事很重视。
为了支援西域的作战，朱载坖再度对于西域的军事指挥体系加以更易，朱载坖将西域南北分为两位不同的防区，北方仍由征西大将军、襄国公李成梁负责，同时李成梁仍旧是西域的最高军事统帅，全权负责西域战事，但是李成梁主要是在西域北方对于卫拉特四部，现在对于西域南部的战事确实是无暇顾及。
所以有鉴于此，朱载坖准备任命一位镇西大将军，统帅大军征讨叶尔羌汗国，同时命令陕甘等出地方官府准备足够的粮秣，发运军前，朱载坖之前就已经在陕甘等处以及交河、哈密等地囤积军粮，以备征战，这次朝廷再度兴师，兴兵二十万，征讨叶尔羌汗国，也算是大明兴师极多的一场大战了。
朝廷在西域所投入的兵力已经达到了二十八万余，是现在大明用兵最多的地方，在用谁担任统帅这个问题上，朱载坖是思虑了很久的，兵部尚书梁梦龙举荐杜松兄弟，杜松兄弟以勇悍闻名，这点朱载坖是很清楚的，但是杜松勇而乏谋，这点也是朱载坖所担心的事情，杜松初由舍人从军，累功为宁夏守备，迁东路副总兵。寻起孤山副总兵，擢都督佥事。
其兄杜桐以世廕入仕，历任清水营守备，以谋勇著称。迁延绥入卫游击将军，改古北口参将，经总督梁梦龙推荐擢延绥副总兵，累迁至署都督佥事、总兵官，官至右都督，镇守延绥、保定、宁夏等地。杜松兄弟确实是以勇悍闻名，同时梁梦龙认为他们是沙场宿将，又久在西北，熟悉情况，所以梁梦龙举荐他们兄弟。
但是遭到了提督参谋军务总署军机大臣李如松的坚决反对，李如松认为杜氏兄弟勇而无谋，只可为将，不可为帅，这下一下子引起了梁梦龙和科道的弹劾，他们对于李如松不满不是
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