但是有功的军官，朝廷可以量才拔擢，同时一些资历深厚，但是立功不多的老将，朝廷也可以通过提升他们散官的办法给予荣宠，增加他们的俸禄，这点是很好的。
不过对于大明的武散官制度，朱载坖认为还是要予以改善的，大明的武散官，从正一品的特进荣禄大夫到从六品的忠武校尉，还是相对不够的，所以朱载坖命令吏部和兵部制定从六品到从九品的武散官官阶，实现爵用以定尊卑，官用以分职务，阶用以叙劳，勋用以叙功的武官体系。
同时新的官军体制下，官军的编制组成得到了简化，最小的作战单位仍然是小旗，一小旗十人，但是总旗从五十人下降到三十人，一队辖三个总旗加上队官直属的一个小旗，主要负责后勤、传令等事务，由各队组成营，营的长官称统制，若干各营组成团或者旅，他们的长官都称指挥使，而若干个旅团组成师，长官称都指挥使。
在官军边军中，师已经是最大的编制了，直属于总兵或者提督，作为一镇的机动力量所使用，但是在朝廷，还要组建比师更加庞大的战略预备队，也就是军，古称天子六军吗，按《周礼》《左传》记载周天子设六军，诸侯依国力设三至一军，成为后世“天子统领军队”的代称。晋代以领军、护军、左右二卫、骁骑及游击六支中央禁军合称六军。唐代禁军沿用此名，左右龙武军、神武军、神策军（或羽林军）组成六军体系，朝廷居中以威天下，自然是要建立比地方冯家庞大的战略预备队了。
所以朱载坖决定将京营和亲军诸卫统一整编，设立羽林、天武、虎翼、静塞、保捷、忠锐六军，作为朝廷的战略预备队，同时对于各都司的脱产士卒，一样要予以师旅编制，赐予军号，由朝廷统一调度，这样的话，就实现了官军的京军化，统一平时和战时编制，将所有的脱产士卒归为常备官军，而卫所则是主要承担预备役和屯田等职能。
边疆各军镇虽然下辖各自的团营师旅，但是一样归朝廷统一调度，京军和边军没有制度上的区别，只要朝廷愿意，随时可以将京军调至边疆承担边防任务，也可以随时将边军的师旅调入京军之中，成为天子六军的一部分，这样对于朝廷来说，肯定是加强了对于地方的管理
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