轻则叱责辱骂，重则施加刑杖，而胥吏在挨打之后还要匍匐谢恩，装出满面羞愧无地自容的样子。为了加强对于这些吏员的管理，朝廷规定吏员犯下死罪后，地方主官可以根据法令处决后再向刑部报告，这也就在法律上规定了地方正印官对胥吏的处置权，因此不少地方官以此为借口，欺压手下胥吏，更有甚者对于忤逆自己的书吏更是狠下毒手。
正印欺压吏员，在大明已经不是什么稀奇的事情了，尤其是在县一级，因为现在知县的地位上升，科道官采用行取的方式，使得知县的地位骤然变得强势，因为知县行取科道官之后，其地位扶摇直上，很快便会超过原先的上司，成为都察院的高级言官，或者外放成为其原来上司的上司。而胥吏作为杂途出身，本来就不甚受到尊重，因此胥吏哪怕是蒙受冤屈也只能忍受，并且不敢鸣冤，因为一旦鸣冤，还有更为严重的后果，有些官员们担心，南北更调之后，这些正印官更加强势。