不光是预防措施，更重要的是相应的药品，翰林医官院也确实是研究出了几种药材，对于这些烟瘴所致之病有效果，首先就是金鸡纳霜，这种树是从西洋带来的，朱载坖命令在海南、台湾等地大量的培育、种植，现在已经有一定的数量了，金鸡纳树的树皮可以治疗疟疾，不过现在大明的金鸡纳树海不多，所能够提供药物也确实是不多，除了金鸡纳树之外，还有就是青蒿了。
青蒿清虚热，除骨蒸，解暑热，截疟，退黄之功效。常用于温邪伤阴，夜热早凉，阴虚发热，骨蒸劳热，暑邪发热，疟疾寒热，湿热黄疸等病症，能够治疗疟疾，葛洪就认为：“青蒿一握，以水二升渍，绞取汁，尽服之。”可以治疗疟疾，而且青蒿在大明并不算什么名贵的药材，但是经过翰林医官院的试验之后，青蒿的花叶才有治疗疟疾的效果，所以在朱载坖的指令之下，朝廷开始大量的储备青蒿，为征讨安南做准备。
除此之外，还有一种药物也受到朱载坖的重视，就是止泻药，军中最常见的疾病就是腹泻，不仅仅是疟疾、痢疾这样要命的疾病，就是寻常的腹泻，也是非常之多的，所以止泻药是朱载坖很重要的，浙江湖州所产之胶岭石，经过水飞炮制之后，可以作为良好的止泻药，翰林医官院在缅甸试用之后效果是不错的，朱载坖也命令大量的储备以保证军需。
除此之外就是要准备大量的雄黄、硫磺、石灰、明矾等驱虫净水的物资，官军也要严格纪律，保证良好的饮食习惯，否则的话，疫病还是很有可能在军中爆发，朱载坖还命令准备大量的烈酒，主要是配给于随军的军医用以消毒防止伤口感染的。
同时由于安南多雨，相应的雨具也要予以配发，朱载坖很清楚这些所谓瘴疠很重的地区，往往是积水和丛林同时存在的地方，官军要想平安的通过这些地方，就要准备大量的石灰、雄黄、硫磺等物资，同时将这些地方的积水排干，杀灭蚊虫，具体的办法翰林医官院在缅甸都已经试过了，确实还是有效果的，朱载坖早就命令翰林医官院准备相应的药材，同时培训士卒们的为生习惯，防止军中疫病的流行。
当年大明之所以饮恨安南，主要还是后勤问题，安南时叛时降，阴晴难定。官军
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