责管理澎湖群岛与大员等地的民政治安。
只是这些年因朝廷财政困难与长期对海疆疏于管理，巡检司的兵力早已名不副实，战船多是破旧不堪，士兵也多为老弱，自然无力对抗装备精良的海盗与红毛番。
他原本考虑到辽东的局势和澳门当地的葡萄牙人，所以优先训练建造了登莱水师和广东水师，而三大水师之一的福建水师，因资金问题稍缓一步。没想到就是这么一点疏忽，竟让这些跳梁小丑钻了空子！
“郑芝龙、颜思齐……”朱由校默念着这两个名字，眼中闪过一丝厉色。他记得历史上，正是这两人率领的海盗集团，在万历末年以大员北港为基地，建立武装据点，控制了台湾西南部的贸易网络。
后来郑芝龙虽接受招安，却也只是权宜之计，听调不听宣，始终保持着半独立的状态。
之前徐光启曾上奏，提议招安郑芝龙，利用其船队承担部分漕粮海运，以缓解漕运压力，他当时因水师尚未建成，便暂且应允，如今看来，倒是不必了。
“刘大伴！”朱由校扬声唤道，声音中带着压抑的怒气。
“老奴在。”刘若愚连忙从殿外走进，见陛下脸色难看，心中一紧，躬身侍立。
“你去查查，去年徐光启提议招安郑芝龙一事，进展如何？”朱由校语气冰冷，“若是还未谈成，就不必继续了，就说朕给他们找了一条好出路。”
刘若愚微微一怔，敏锐地察觉到陛下言语中毫不掩饰的杀意，心下暗道：这哪是什么好出路，分明是要送他们上死路啊！
“奴婢这就派人去问。”刘若愚不敢耽搁，转身便要退下。