但丝毫得不到占领区中国人民的响应，还引起了迷信武力征服的东条英机等人的不满。东条英机等人认为，板垣、石原、辻政信等人鼓吹的“东亚联盟运动”，“含有使日本的主权意义模糊不清的因素，如果推进这一运动，就必须承认朝鲜民族的独立自主，台湾问题也不好办，当然贻害无穷”。
不久，东条英机禁止“东亚联盟运动”，并转调板垣征四郎为朝鲜军司令官，石原莞尔被转入预备役，辻政信调任为“台湾军研究部部员”，一度大吹大擂的“东亚联盟运动”，就这样迅速破产了。