缓和，杜桑宣布忠于拿破仑，法国政府任命杜桑为圣多明各总督，统治整个海地岛。
与英国抗争打败西班牙之后，因为当时英法两国处于对抗时期，且英国占领区未废除奴隶制，杜桑遂联合法国继续抗击英国，英国受到了巨大的损失，并与海地议和。使英国于1798年撤离海地。
任总督时期
1796年，杜桑·卢维杜尔担任圣多明各总督，在担任总督期间，与美国和英国签订了贸易协定，并努力改善圣多明各的安全和经济，训练了大量的军队，为日后海地抗法战争奠定了基础，在任总督期间，他平定了海地岛南部的叛乱。
在1801年，他颁布了海地宪法和独立宣言，宣布海地是一个独立的国家，并废除奴隶制度，所有海地人不分肤色、种族，一律平等。
与法军斗争
海地召开制宪会议后，使拿破仑十分震惊，为此，拿破仑命令自己的妹夫查尔斯·勒克莱尔远征海地。
1801年12月，查尔斯·勒克莱尔率领54艘战舰、3万名士兵，开始了企图恢复法国殖民统治的远征。
杜桑领导起义军坚决保卫自由海地。他对战士们说：“我们已经取得了自由，我们黑奴世代受欺凌的时代已经一去不复返了!现在，法国人又回来了，他们企图从我们手中夺去我们的自由，我们宁可战死也不决不能答应他们!让我们共同奋斗吧!我们要让法军饿死、渴死、累死，让海地变成这些强盗的活的地狱!努力吧，自由属于我们!”
当3万法军来到海地的时候，起义军就在他们要登陆的地方点起火来，烧毁那里的一切，法军所到之处，一片灰烬，只有满地尘土、满眼浓烟似乎在怒视着这些远道而来的不速之客。
法军找不到吃的，饥饿难忍。他们甚至找不到喝的，因为水中已被起义军下入了毒药。法军的战斗力大大削减，勒克莱尔大伤脑筋。此外，起义军利用有利地形，四处出击，法军不时有人阵亡，法军狼狈不堪，到处挨打。
杜桑之死
杜桑与法国进行多年战争后，遭受了巨大的损失，杜桑被迫与法军议和。与此同时，勒克莱尔正想方设法抓住杜桑。不久，勒克莱尔想出一条毒计。
勒克莱尔写了一封言词恳切的信给杜桑
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