两地港口地位由此并列。
泉州地处晋江入海口，连通内地海洋，拥有包括后渚港在内的诸多深水港。
南宋嘉泰四年，两广巨富蒲氏家族“家资益落”，蒲开宗举家迁往泉州，继续开展香料贸易。
淳佑十年，宋廷提举蒲开宗之子蒲寿庚为泉州市舶，在此期间，大量阿拉伯人来到泉州，极大促进泉州经济发展。
元末，各派势力在泉州相互争斗。
“泉民先经回寇涂炭，继为友定荼毒”，商业遭到严重破坏。
加之明初海禁政策打压，倭乱影响，这座依靠海外贸易的城市，渐渐走向衰落。
除了人祸，泉州港衰落的原因，还有淤积。
在泉州港兴盛的时期，远洋货船可以一直开到九日山脚以及洛阳江口，而到了明末，洛阳江口几乎成了滩涂。
太初三年，郑氏海盗集团在辽南海战中惨败，郑森退往倭国，投靠幕府德川家光。
郑森的溃逃，造成郑氏势力四分五裂，也直接导致明国在福建统治的全面崩溃。
广德三年，浙江江苏新政完成后，第七兵团(骑兵团）奉命由浙江南下，进入福建，沿途几乎没遭遇任何抵抗。
史书记载，（明军）不战而降者，“大小官一百九十一员，马步兵两万三千人”。
广德三年六月。
第七兵团前锋越过仙霞岭，于汀州击溃残明军队，斩首千余，隆武帝朱聿键、鲁王朱以海率残部狂奔逃窜，后逃入泉州，作困兽之斗。
七月初，第六舰队炮击泉州城。
此时，驻守泉州的明国福建总兵曾国祚，兵力四千，负责防守泉州周围的县城以及要塞。
守军有“浙直兵一千七百名，本地土兵一五百名”共计三千二百人。
以及萨摩武士七十七人，佛朗机诸国水手商人四百五十人。
火炮舰船齐备，周围还有左良玉残兵一部三千人。
广德三年七月十五日，第七兵团主官王增斌令第一营、第二营会同登陆洛江口的第六舰队一部，共计八千人马，合力围攻泉州。
史料记载：“一时山海并发，四面蜂起，各乡村叛民为之羽翼，建立寨堡，城中奸徒为之腹心，意图内应”明贼拼死抵抗，而城外各
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