余移民无一感染，均得以保全。
但岛上的土著部落则损失惨重，哀鸿遍野。
到十月初疫情基本平息时，经过粗略探查的结果显示，整个岛上的土著部落人口锐减了约三到四成，死亡人数在五千至六千之间。
昔日充满生机的丛林部落变得一片死寂，许多小部落甚至整体消亡，整个岛屿顿时显得空旷了许多。
面对这场灾难，新华拓殖当局展现出了务实而长远的策略。
他们对岛上的土著采取了有限度的救助措施：向幸存部落分发少许粮食，提供一些酒水作为慰藉，并指导他们按照新华的方法处理尸体、消毒环境，以防止疫病进一步传播。
这些举措成本不高，却效果显著。
土著们此前因土地被占、交易中处于劣势而积攒的不满情绪，在生死考验和这点“恩惠”面前迅速冰释。
他们甚至觉得，这些来自东方的新华移民，虽然同样武力强大，但似乎比那些贪婪而又残暴的西班牙人要“亲善和慷慨”得多。
新华拓殖管理人员迅速抓住了这个机会，向周边一些残破的部落宣扬“集村并户、编户齐民”的好处，试图将松散的原住民社会逐步纳入新华的行政管辖体系。
比如，集中居住可以获得新华人提供的武力保护。
比如，在遭受自然灾害的情况下，能给予粮食及其他物资救助度过难关。
比如，新华人可以派人指导和组织他们的农业生产，获取更为充分的粮食需求。
比如，共同抵御外来入侵者（西班牙人）。
这一过程虽然并非全无波折，但在瘟疫的阴影和西班牙人这个共同敌人的映衬下，倒是较此前推进得相对顺利。
至十一月初，来自吕宋拓殖区的一艘联络船的到来，为安澜岛运来了大量物资和数十移民外，还带来了吕宋拓殖专员的命令：立即着手攻占圣费尔南多岛（关岛）。
此时，经过五年多的经营，安澜岛和云汀岛上的新华移民总数已超过七百人，其中青壮年男性占七成以上，装备有火枪和少量火炮，无疑是这片广阔海域中最强大的一股势力。
反观西班牙人在圣费尔南多岛的状况，则日益窘迫，王小二过年，一年不如一年。
该岛自1565年被西班牙殖民占领后，始终未曾真正用心经营。
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