箱在天津就地疏散了：一部分存放在瑞士商人在天津建造的仓库里，一部分存放在法租界巴斯德研究所，一部分存放在中国友人家里。疏散前，福莱医生没有打开过标准化箱子。
战争结束以后，装有帝京猿人化石的标准化箱子下落不明。中国的无价之宝经美国海军陆战队之手，由帝京至秦皇岛，由秦皇岛至天津，最后在天津失踪。
帝京猿人化石到哪里去了？一种说法是，标准化箱在秦皇岛被装上了“哈里逊总统”号轮船，但该船不幸在赴美途中沉没。帝京猿人化石沉入了海底。有人说，轮船没有沉没，而是中途为日军所截获，化石落入日军之手，后来下落不明。
另一种说法是，帝京猿人化石根本就未出北平城，它被埋在美国驻京公使馆的后院里。一个在美国海军陆战队总部门口担任过守卫之职的卫兵回忆说，珍珠港事件爆发前夕，他看到有两人将一箱东西偷偷地埋在院子里，他估计有可能是帝京猿人化石。
听了这些，杨波微微皱眉，他看向曹元德，“这就是全部了？你既然想要让我找到遗骨，那就应该是有更为确切的消息的！”
曹元德笑道：“不要心急，我还没有说到呢，最近一段时间，我们的特殊部门，在和倭国的的交锋中，发现了一些未经解密的证据，接过翻译，发现了周口店猿人遗骨的下落！”
“在哪里？”杨波有些吃惊。