不仅是这些州县官吏，对于朝廷的督抚、布按以及各道、府等地方大员，一样也要予以严管，首先就是督抚衙门的属官、吏员问题，原本督抚只是临时钦差性质，事毕即还，巡抚、总督等地方大员，并没有固定的属官，而是往往从地方官府或者布按二司中抽调属官和吏员到督抚衙门中办差，使得本就缺乏官吏的地方官府官吏更少。
而这些督抚大员们出镇地方，往往建立幕府，幕府又可以指文武高官出征时搭建的营帐或者巡抚地方时的衙署。“幕府”之中的长官，被称为“幕主”，而辅佐“幕主”的人，则有“幕官”和“幕宾”两类人。
所谓的幕官，简而言之就是将官们公署之中的属吏，本身就归属于朝廷正式的官僚系统，一般是从辖区内的各级官府中抽调而来的。
而除了这些人之外，就是大明的所谓幕宾，也就是督抚官员们自己私人聘请的类似师爷性质的人，幕宾和幕官的不同之处在于，幕官虽然也听命于幕主，但幕官是由朝廷分给的属吏，名列官籍，身份为官；幕宾则是由幕主私人聘请的辅佐人员，身份为客，不食朝廷俸禄，一切待遇均由幕主给支，两者合称就是我们常说的幕僚。
原本这种制度从唐宋以来确实有存在，大明的这些督抚大员也经常开幕府，广请幕宾，王守仁担任督抚的时候就曾经说过：“凡荐贤于朝，与自己用人又自不同，自己用人，权度在我，故虽小人而有才者，亦可以器使。”
大明的这些官员的，一旦出镇，往往都要聘请大明的幕宾为自己的服务，很典型的代表就是胡宗宪，他在担任浙直总督的时候，就大量的聘请幕宾，为他服务，为了养活这些幕宾，胡宗宪也耗费了不少银子，所以当年弹劾胡宗宪为总督银山并非空穴来风。
大明的这种幕宾制度虽然是沿袭自前代，但是大明初年时，朝廷为各级地方行政公署都设有幕属官，这一类幕职并非由长官自己征辟，而是朝廷负责铨选，使得幕属官一方面配合长官工作的同时起到了监督长官的作用。随着时间的推移，情况逐渐发生了变化，虽然公署有幕职，但是有司并不器重他们，反而自己聘请幕宾治事，或者将具体事务托付给胥吏，后来新任的总督、巡抚等封
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