朱载坖之所以一直没有将这个想法抛出，是因为朱载坖要观察臣子们反应，一直以来，大明就只有七个正二品衙门，六部加上都察院，其他的就算是大理寺这样的三法司要害衙门，不过仅仅是三品，所以对于在大明再设立一个二品衙门，朱载坖是很慎重的，这是将重八哥制定的祖制予以推翻了。
之前的所谓总理盐政、提督钞关等衙门，毕竟还是在六部体系之下的产物，并不算突破祖制，但是设立一个二品衙门与六部并驾齐驱，显然是对祖制的突破，所以朱载坖要慎重起见。
对于汪道昆和刘体乾的争执，朱载坖采取了放任的态度，静静看他们的表演，两位部堂争过一会之后，都请求朱载坖圣裁此事。
朱载坖笑着说道：“这海关，一定要归户部，或者兵部吗？朕看不一定吧，海关之重，上干朝廷，下系民生，不可不重，朕以为，归于户部，或者是归于兵部都似有不妥。”
朱载坖的看法很简单，海关应该单独设立一个衙门，从属于户部和兵部都不合适，海关既是一个和外国人打交道的衙门，又是现在朝廷的重要财源，同时海关麾下的缉私水师也是非常重要一支武装，所以归属了哪个衙门都不太合适，而是应该单独设立一个衙门，专门负责管理大明的进出口事务。
不仅仅是海上的贸易，陆地边境的贸易和征税也要由这个衙门来负责，所以朱载坖认为应当专门设立一个二品衙门来负责管理此事，与六部平级，当然，海关关税是要解运太仓的，同时海关下辖的缉私兵力，不管是水师还是陆军，也要受兵部的管理。
对于朱载坖的这个看法，重臣们是有些诧异的，毕竟朝廷六部七卿是惯例，这下海关也要升格为二品衙门，与六部七卿同列，这似乎有些过于出乎臣子们意料了。
但是朱载坖决心已定，他向臣子们陈述了自己的理由，六部是从尚书省演化而来的，之前六部确实可以应对大明的日常政务，但是现在显然不行了，海关就是很典型的例子，从执掌来说，海关的主要责任是为朝廷征收赋税，似乎是户部的业务，但是海关麾下由大量用于缉私的官兵，这又和兵部有关，由谁来管，都不合适。
最好的办法就是新设以衙门，专司此事，之
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