，从一个单纯的监察机关，变成了内阁控制朝政的重要抓手，要想让内阁自断一臂，显然是不太现实的。
从成化以后，六科给事中在这些事项上积极发表意见，提出建议，甚至有时关于国家大事、政策弊病、民间疾苦，几乎都是由六科给事中最先提出来，六部据此研究覆奏意见，而对于六部的覆奏意见，六科又可以封驳、抄参乃至纠劾，部科关系已经完全颠倒。
六科凌驾于六部，而内阁又操弄六科，六部从大明朝廷的行政机关变成了为六科、内阁的办事机构，而本来是天子耳目的六科，则成为内阁的打手，真是奇哉怪也！
现在王锡爵要求回到原来的制度，剥夺六科不该有的权力，这当然是内阁们不愿干的事情，一旦没有六科的支持，内阁能否按住六部，尚未可知也。
现在六科的权力已经渗透进了六部行政的方方面面，如吏部选官，没有吏科给事中的配合即进行不下去；户部、工部等涉及到财政、工程等方面的事项，必须要有给事中的参与，才能够完成相关程序。以户部派遣官员催督税粮而言，必须要户科都给事中赴司礼监领取勘合批文，官员才能派遣出去。其他部院，包括大理寺、太常寺、太仆寺等的重要工作，也大多类此。
所以对于王锡爵的这个建议，内阁认为不妥，当然冠冕堂皇的理由是六科要加强对于六部的监察，才能更好的推动朝政，打击贪墨。
王锡爵还想继续陈述自己的意见，但是朱载坖派人到文渊阁叫王锡爵觐见，王锡爵只得到朱载坖这里来，王锡爵到文华殿的时候，朱载坖正在翻阅皇明祖训。
见王锡爵来了之后，朱载坖笑着说道：“王学士最近可是做的好大事啊！”
王锡爵赶紧说道：“臣之愚见，恐污圣听，但只有一点孤忠罢了！”
朱载坖笑着说道：“恩，一点孤忠，说的好啊，朕要的就是王学士这一点孤忠，有这一点孤忠，就比很多人好了！”
朱载坖给王锡爵赐座之后，问道：“元驭（王锡爵字）是朕在潜邸时就熟悉的了，你学贯古今，为朕说说，给事中在我大明是个什么官啊？”
王锡爵想了想对朱载坖说道：“陛下，给事中乃陛下之近侍官员也！”
朱载坖看了王锡爵一眼，这才
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