朱载坖的一系列诏书颁布之后，对于宗藩们来说显然是极为不利的。朱载坖用保障宗禄作为条件，要求宗藩们放弃侵占和投献的田地，这对于他们来说是不可接受的，但是朱载坖处理蜀王、辽王等藩王的雷霆手段都使得他们不敢轻易的违逆朱载坖的意思。
他们很清楚，朱载坖为什么要重新设立宗人府，就是要收拾这些宗室们，因为朱载坖和宗室们很清楚，之前那些惩罚宗室的办法已经对他们没有什么大用了，下旨申斥他们置若罔闻，要想将他们送凤阳高墙，他们的罪行还远远不够，所以朱载坖才将之前被废弃的宗人府重新弄了起来。
原因很简单，就是利用宗人府对这些宗藩们进行管束，对那些对抗朝廷新政的宗藩们加以惩戒，虽然不能将他们送往凤阳高墙囚禁，但是可以送京师宗人府囚禁，虽然名为交宗人府管束，但是实际上就是囚禁，具体要囚禁多长时间，也就看皇帝的心情了。
所以宗室们虽然不敢把朱载坖怎么样，但是对于帮助朱载坖打击宗室的郑王朱厚烷他们极为不满的，楚王、靖江王、沈王等上疏朱载坖，认为既然朱载坖要恢复祖制，重新设立宗人府，就应该照太祖时的旧制来办的，太祖的宗人府，是有太祖的几个儿子来担任宗人府的长官的。
宗人令，一人秦王朱樉任，左宗正，一人晋王朱棡任，右宗正，一人燕王朱棣任，左宗人，一人周王朱橚任，右宗人，一人楚王朱桢任，他们认为还是应该都这些大藩藩王来担任，而不是郑王这个罪宗来担任，他们认为郑王在嘉靖时被囚禁高墙，尽管朱载坖登基之后将其释放，但是朱厚烷本人确实是罪宗，不宜担任宗令这一职务。
对于他们的想法，朱载坖很清楚，就是想换掉朱厚烷，他们认为朱厚烷只听朱载坖的，不敢维护宗藩的利益，不是一个称职的宗令。
朱载坖随即下旨给秦藩，直接询问秦藩是不是有当宗令的打算，现在的秦王是朱敬镕，这位的合法性也是有极大的问题的，当然他的问题主要是来自于他爹，秦宣王朱怀埢，朱怀埢原本只是一个镇国中尉，但由于秦简王朱诚泳无子，由第三代临潼王朱秉欆袭秦王，而朱秉欆的儿子昭王也只有唯一的一个儿子定王朱惟焯，定王
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