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大理寺复审无误的死囚，法司以死罪请旨，刑科三覆奏，得旨行刑。
但是这等大案，嘉靖不准备按照常理处置，准备直接勾决一干人犯，决不待时。
嘉靖说道：“周如斗身为巡按，本为朝廷耳目，监察州县，反而与地方豪强沆瀣一气，罪不可赦，苏州各官所拟，悉合律法，将周如斗明正典刑！”
嘉靖说完就在周如斗的名字上打了个勾，交给黄锦，但是令嘉靖为难的是主、吴、徐三家的处置，嘉靖当然也认同朱载坖的想法，要是真的可以和王直贸易，势必需要祝家作为皇室的工具，但是单独赦免祝家，总是需要一个说的过去的理由，祝家投靠朱载坖的事情是不能拿到明面上来说的。
否则日后祝家做生意，一下子就会和朱载坖联系到一起。同时，嘉靖也不认同朱载坖所说的仅仅对祝家抄没家产的处理办法，在嘉靖看来，祝家毕竟也是欺君，必须要付出代价，否则他们对皇权就缺乏敬畏。
嘉靖说道：“诛戮三家，这许多人，毕竟是有伤天和啊。”