，也就是地主豪强的兼并战争时期，日本国内是群雄并起的时候，之前掌握与大明贸易堪合是是大内氏。
而在日本天文二十年（嘉靖三十年）八月，长期掌握中日勘合贸易权的大内氏遭受重创，大内义隆家臣陶隆房(后改名晴贤)发动叛乱，大内义隆被迫自杀，勘合也被战火烧毁，而幕府政府也因战乱无暇顾及勘合贸易，这下好了，中日之间的正常贸易算是彻底断绝了。
中日勘合贸易制度在实施之初，虽然存在诸多问题，但在一定程度上保证了中日之间相对正常的贸易往来。然而，中日勘合贸易凭证在战火中烧毁，无疑使得原本可以从事中日贸易的倭人失去了谋生之道，从而走上了掠夺之路。
现在的倭寇，还是相对比较纯正，真倭比较多，据锦衣卫的调查，现在的倭寇，主要是由海盗、奸商、武士、浪人、流民、亡命，在大名(封建领主)支持下，勾结中国的奸商、凶徒、逸囚等不逞之徒，以及蒙蔽一些沿海百姓，组成一支庞大的海盗队伍、向大明沿海进行掠夺的武装集团，虽然也有不少汉人，但是作战的主力还是真倭，后来倭寇壮大后，主要就是沿海投敌的汉奸了。