朱载坖也认为对于大明和蒙元的关系是必须要予以说明的，大明的承元，是天命的转移，也就是天命从孛儿只斤氏转移到了朱氏来的，大明所承元的也就是天命，这是必须要予以认可的，蒙元的灭亡是因为其倒行逆施，天心厌恶所导致的，并非大明以力取之。
同时以太祖圣训对蒙元的倒行逆施予以解释：“胡元入主中国，非我族类，风俗且异，语意不通，遍任九域之中，尽皆掌判。人事不通，文墨不解，凡诸事务，以吏为源，文书到案，以刊印代押。于诸事务，忽略而已，此胡元初治焉。三十年后，风俗虽异，语言文墨且通，为官任事者，略不究心，施行事务，仍由吏谋，比前历代贤臣，视吏卒如奴仆，待首领官若参谋，远矣哉。”
申时行也将其总结为两点，本朝取天下是从元末群雄手中夺取的，蒙元无道，天下失之于群雄，太祖皇帝拯救黎民于水火之中，削平群雄，建立大明，本朝的建立和蒙元的灭亡没有关系。
而天命是由于蒙元失德，从而转移到了朱氏，这是天意，同时对于蒙元的正统性予以否认，虽然宋末失德被蒙元所灭，但是蒙元入主中原之后，倒行逆施，如“胡僧嗣古妙高欲毁宋会稽诸陵，时夏人杨辇真加为江南总摄奏请如二僧言，遂发诸陵取其金宝，以诸帝遗骨瘗于杭之故宫，筑浮屠其上以厌之，又截理宗顶骨为西僧饮器，天下闻之莫不心酸。”
蒙元破坏南宋陵寝等一系列的行为，都是极为令人发指的，正是由于如此，才使得天心厌恶，天命转移的，这点也是极为重要的，就是将华夷之辩和大明的正统性相结合起来，对于太祖在大明初年所采取的一系列政治操作采取春秋笔法，明确重申大明的正统性，这点是极为重要的。
王锡爵就说道：“陛下，中国之与夷狄，其限至明而其防至严也。是故内中国而外夷狄，尊中国而卑夷狄，进中国而退夷狄，贵中国而贱夷狄。若天地之不可交覆，若君臣之不可易置，若首足之不可倒悬也！华夷之分如此，孔子作春秋严乱臣贼子之诛罚者，为世道立大防也。至於夷狄与中国竞，尤必谨遏而深抑之。岂非荐食上国縻灭人类，有甚於乱贼之当诛者。歟自有典籍以来犬戎覆宗周、弑幽王，而周人不能
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