朱载坖作出了决定之后就先让重臣们回去了，而后朱载坖和太子开始商量此事了，朱载坖问道：“太子以为，此事现在应该怎么处理啊？”
对于朱载坖的这个问题，太子也在思考，太子说道：“父皇，这次申阁老他们出了大力，然苏松士绅，亦不可不防啊。”
朱载坖闭着眼睛只是只是点点头，申时行他们促成此事，只不过是为了借朝廷之手打击这些闽粤海商罢了，这点朱载坖是很清楚的，在这个目的上，朝廷和东南士绅们的目的是一致的，所以这些申时行等人才会积极配合朝廷，但是在具体打击到什么程度这个问题上，朝廷和这些东南士绅们的目的是显然不同的。
朝廷要的是加强对于闽粤地方的控制，打击宗族势力，建立朝廷的威信，同时整顿走私，保证朝廷的赋税，所以对于闽粤的打击主要是针对的走私商人和地方宗族势力，但是东南士绅们显然是希望朝廷打击整个闽粤商帮，好为东南的这些商人争取时间，这不是朱载坖想要的，不能够让东南一家独大，这点一向是朱载坖的政策，所以在这点上，朝廷和东南士绅们显然不是一个路子。
而在申时行的府上，一众东南出身的官员都聚集在一起，朱载坖命令为朱纨加以赠谥，同时对于林希元家族加以重惩，这都是东南士绅们所乐见的，他们希望朝廷能够进一步加大打击闽粤海商的力量，这样是东南士绅们所乐见的。
但是申时行可没有这么乐观，他很清楚对于朝廷来说，打击这些闽粤海商的问题和东南士绅们是完全不同的，这点申时行作为首辅是很清楚的，朱载坖作为皇帝，自然是要打击闽粤的地方势力，但是对于东南士绅集团，朱载坖同样是极为防备的，所以申时行十分之清楚，事情的发展不可能完全按照东南士绅们的想法进行。
要使得自己的利益最大化，必须趁着这个机会在闽粤安排人手，同时在朝廷政策上对于闽粤海商进行尽可能的限制，以保障东南士绅的利益，这两个问题都是不好解决的，要想在闽粤安排人手，要通过吏部才行，而现在吏部尚书杨俊民是醋党大佬，文选司郎中方从哲也是太子的人，要向他们通过，恐怕并没有这么容易。
在户部尚书庞尚鹏尽管在这次朝廷收拾闽粤一
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