西域的情况复杂，所以朱载坖认为必须要提前准备，凡事预则立不预则废，有备无患总比有患无备强，这点朱载坖还是很清楚的，所以朱载坖命令按照官军一月之需准备应急口粮，并且发运军前，同时为了保障官军的饮水等事情，朱载坖还命令准备大量的水壶、水囊等装备，保证官军在西北的饮水问题，之前已经向官军发运了一批水壶，但是朱载坖仍然认为不足，所以继续向西北发运这些装备。
而在朝廷上，在太子的领导之下，针对闽粤两省的这些豪商，也拟定了一个相应的处理办法，太子和内阁辅臣、部院重臣以及闽粤等地的督抚们商量了之后，还是决定以整顿吏治作为主要的抓手。
经过太子和大臣们的商量，决定首先补齐广东道和福建道的御史，对于这些御史们加以整肃，同时增加两省的巡按御史数量，加强朝廷对于地方的监察，首先将这些贪官污吏予以罢黜法办，然后吏部要慎择良吏，前往闽粤等地，使得闽粤等地的百姓感受到朝廷的关怀。
这就是涉及到吏部文选司了，对于新上任的文选司郎中方从哲来说，现在压力是很大，整个文选司刚刚被朱载坖团灭，从官员到吏员都是新调任来的，彼此之间并不熟悉，这点对于文选司这样的衙门来说，是极为要命的。
署部事的左侍郎杨俊民当然知道这种情况，为此他专门将方从哲找来，询问相关的情况，杨俊民问道：“方铨郎上任，可还顺手？”
方从哲对杨俊民说道：“部堂，眼下文选司还是需要时间整顿。”
这点杨俊民当然是知道的，文选司现在刚刚大清洗了，所有的官吏都是从其他衙门调来的，这点杨俊民自然是知晓的，但是朝廷的铨选，这是何等重要的事情，须臾不能停的，所以尽管知道这些难处，杨俊民还是要催促方从哲尽快将铨选恢复正常。
对于这点，方从哲是很清楚的，他详细拟定了一个对于文选司的改革方案，简单来说就是分科办公，在文选司下设各科，将文选司的事务予以分解，使得朝廷的铨选流程更加清晰，方从哲认为在文选司下应设：求贤科：承办双月官员注册，进士、举人截取，拣选举人，并恩、拔、副、岁、优贡生就职、就教，考取御史、誊录，各省道府以下各
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