是朝廷可以在这次修订工商税的则例中将之前不合理的一些条款予以修改，这样的话，朝廷和商人之间就能够达成一种平衡了，但是他们显然不是这么想的，他们抱着所谓的关市不征不放手，想要逼迫朝廷让步。
申时行对此也是极为无奈的，朱载坖并非不可以谈的人，但是朱载坖对于官员之间的抱团结伙行为一向是非常之厌恶的，而且是抱团结伙想要逼迫朱载坖让步，申时行很清楚，这是绝不可能的，肯定会招来朱载坖的严厉打击，胡汝宁的下场就是例子，但是要是申时行现在就上疏明确自己的立场，他们肯定就会把矛头指向申时行，这不是申时行愿意的事情，所以申时行采取的办法是一言不发，不表明自己的态度。
但是对于朱载坖，申时行必须要说明自己的态度，并且提醒朱载坖，否则的话，日后清算起来，申时行就说不清楚了，所以申时行向朱载坖说明了此事，朱载坖对于他们私底下的活动也是很清楚的，朱载坖只说了一句：“且自由他！”
在申时行走后，朱载坖下达了一系列的诏命，对于人事进行了调整，朱载坖升原协理京营戎政兵部左侍郎赵锦户部尚书兼提督税务总署，起复原宣大总督陈其学为兵部尚书协理京营戎政，加中军都督府左都督、锦衣亲军都指挥使陆绎少保兼太子太保，赐忠诚伯，不予世券，忠诚伯也是当年嘉靖追赠陆炳的爵位，朱载坖变相实现了陆家的爵位世袭，虽然陆绎的忠诚伯也是流爵，并非世袭，但是厂卫以缉捕功劳封爵，已经是很不得了的事情了。
同时朱载坖特旨升前首辅张居正长子张敬修为顺天府少尹，升原首辅徐阶之孙徐元春为顺天府尹，原兵部左侍郎吴兑升兵部左侍郎兼户部左侍郎，提督海关总署，原大理寺卿吴时来升刑部左侍郎提督律例馆，原兵部右侍郎兼右佥都御史，巡抚贵州曾省吾调巡抚保定等处。
同时对于北直隶的行政关系再次予以调整，原本京师附近的兵防有蓟辽总督负责，但是现在蓟辽总督所管辖的面积实在是太大了，所以朱载坖在和内阁以及相关部院商量之后，撤销总督蓟辽、大宁、吉林等处军务事，改为两个独立的总督辖区，负责京师防御的直隶总督，和负责东北防御的辽宁总督。
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