策妄阿拉布坦常有冲突，甚至时常互相攻伐。”
历史上康熙二十九年噶尔丹起兵东征，随即正式和大清爆发冲突，而早在前一年，他的老家就已经后院起火，其侄子策妄阿拉布坦起兵击溃了他，而噶尔丹却在被侄子打的人仰马翻、核心根据地摇摇欲坠的情况下，竟然没有留下任何后手就起兵大举东征，果然，在他东征之时策妄阿拉布坦便趁虚而去占据伊犁和北疆地区，甚至没有遇到任何抵抗。
在乌兰布通之战爆发前，噶尔丹手下的兵马已经彻彻底底沦为一支无补给、无支援、无粮草的孤军，以至于“下人散亡略进，又极饥窘，至以人肉为食”，被清军一战而败便一蹶不振、最终走向败亡，自然也就不是什么奇怪的事了。
当然，噶尔丹败亡恰恰也证明了历史的趋势不是消灭某一个关键人物就能扭转的，策妄阿拉布坦联合清廷攻击噶尔丹，可他最后也带领着准噶尔部成了清廷的大敌。
“还有对叶尔羌的统治，单纯的游牧民族，是根本不可能对中原政权产生威胁，一定是占据了某个稳定产出的农耕区域，拥有了稳定的农耕和手工业产出，形成复合型的半农半牧的国家，才有和中原政权持久作战的能力，汉唐的匈奴、突厥，成吉思汗的蒙古，乃至于明末的满清崛起，皆是如此。准噶尔部能够崛起并被黄教选中作为主导者，也是因为他们占据叶尔羌汗国之后具备了农耕和手工业生产的能力。”
“可噶尔丹在南疆的统治却是十分粗暴的，掌控力也严重不足，依赖于当地的豪强贵胄实行间接统治，准噶尔的疆域看起来辽阔，但噶尔丹的政令能够实际覆盖的地方，其实只有伊犁河谷和附近的北疆一些地区而已。”
历史上噶尔丹在南疆的残暴统治，甚至到了清末左宗棠收复新疆之时都让当地百姓记忆犹新，将同样残暴的阿古柏比做噶尔丹，然后“喜迎大清王师”，可以说清廷能够统治西域这么多年，和准噶尔部这些更加残暴的统治者的“贡献”不无关系。
噶尔丹败亡之后，其侄策妄阿拉布坦向清廷“臣服”，充分吸取了噶尔丹的教训，一方面开始笼络和缓和与周围汗国部落的关系，一方面便是巩固内政加强对南疆的控制，花了几十年的时间
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