务大臣们的商量，三个都司负责大同、宣府、山西三镇各边堡和城市的守备和防御。
朱载坖等人经过计算，除了划归给卫所的边堡士卒之外，各卫所出十分之二的士卒，就可以完成边堡和城市的守备任务，凡是脱产的士卒，其待遇都是一样的，不分卫所和募兵出身。
而宣府、大同、山西三镇的官军，则主要成为野战部队，以营为单位，负责互相呼应和出塞击敌，按照辖区设置相应的游击、参将等军官，负责支援本辖区的所有边堡，在朝廷决定执行大规模征讨任务的时候，也只调用三镇的官军，而不调用三都司的官军。
朱载坖的改革主要是为了提高官军的战斗力，保障官军的待遇，之前由于大明军制混乱，往往出现的情况是：“主兵不足，增以募兵，募兵不足，增以客兵，调集多于往时而坐食愈众。屯粮不足，加以民粮，民粮不足，加以盐粮，盐粮不足，加以京运，馈饷溢于常额，而横费者滋甚。”
各种不同的军制，导致的结果是就是看似朝廷在九边军镇屯驻了六十多万大军，实际上能用的有多少？大部分朝廷的饷银和军储并没有落入士卒的手中，反而被各级将校和官员们层层瓜分了，朱载坖决心要改变这种情况，永乐时九边不过二十四万人，多亦不过四十万，现在大明在九边屯驻六十万大军，其中到底有多少空额，只有天知道。
统一军制的另外一个目的就是统一营制，大明之前的营制混乱，一镇、一协一营到底有多少人，从无定制，全凭总兵心情，需要多少士卒，应该编制多少兵器，步兵、多少、骑兵多少、战马多少、火炮多少，从无一定之规，这是朱载坖要改变的事情。
朱载坖现在就是要统一编制，这样才方便官军的指挥调度和训练，同时诸军兵种合同训练，培养官军步炮骑协同作战的能力，戚继光之前在蓟镇搞的车炮营就很有参考价值，朱载坖的意思以蓟镇车炮营为蓝本，制定一个编制制度，主要是两种编制，步炮骑合编合训的常设协，还有就是单独的骑兵单位，以骑兵为主要的作战力量，编制骑兵、炮兵等作战力量。
朱载坖认为，最大的单位就是镇了，一镇下设若干协和标，骑兵以标为单位编制，骑兵每标为一千
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